Kuliah

Teks: Timothy DW Claridge, Teknik High-Resolution NMR di Kimia Organik, 2. . Ed , Pergamon, Oxford, 2009. 
DL Pavia, GM Lampman, GS Kriz, Jr., Pengantar Spektroskopi: Sebuah Panduan untuk Mahasiswa Kimia Organik, 3. Ed. , WB Saunders, Philadelphia, PA, 2001. Silabus

Sumber

Spektroskopi NMR

JCAMP NMR dan IR spektral Tampilan (Internet Explorer, Safari, dan Chrome)

1 H Kimia Pergeseran Prediksi substituen Pendekatan Constant untuk Pergeseran Proton Kimia.

13 C Kimia Pergeseran Prediksi substituen Pendekatan Constant untuk Pergeseran Proton Chemical. (Java tergantung versi)

Vicinal Spin-spin Coupling Constant Prediksi Persamaan Altona-gaya untuk 1 H- 1 H 3 konstanta J di alkana (sp 3 -SP 3 ).

Vinyllic dan alilik Spin-spin Coupling Constant Prediksi Persamaan Karplus-gaya untuk 1 H- 1 H 3 J vinyl dan 4 konstanta alilik J di alkena (sp 2 -SP 3 ).

JMM: 1 Orde multiplet pembuat untuk multiplet spin-berputar membelah (atau, JMM: versi alternatif tanpa frame atau estimasi J)

JJ: 1 Orde Spin-spin multiplet Pancar untuk menentukan konstanta kopling J dari 1 H NMR spin-berputar multiplet membelah (dalam pengembangan)

Deconvolve: NMR spektral Pancar dan Puncak Memilih untuk puncak otomatis memetik berdasarkan Fourier Transform dekonvolusi spektral. Applet ini berguna untuk membuat daftar puncak untuk berbasis JJ spin-berputar multiplet dekonvolusi, di atas.

JD: Spin-spin Memisahkan Simulasi sampai enam berputar. [Versi Old Java merencanakan: JD (Java diperlukan) ]

Efek: Kimia pertukaran Lineshape Simulasi untuk 2 pertukaran situs (menggunakan Java untuk merencanakan). Jika Anda tidak ingin menggunakan Java tergantung penggunaan versi Exchange (Netscape) atau Exchange (IE) untuk Internet Explorer.

Spektrometri massa

Fragmen Finder menemukan formula mungkin yang cocok dengan massa molar diberikan. Kemudian M + 1 dan M + 2 rasio dan massa yang tepat dari masing-masing fragmen yang mungkin dihitung. 

Formula Finder menemukan formula mungkin yang cocok dengan massa molar diberikan dan beberapa fragmen. Kemudian M + 1 dan M + 2 rasio dan massa yang tepat dari masing-masing fragmen yang mungkin dihitung. 

Massa Molar Finder menebak kemungkinan massa ion molekul jika spektrum Anda mungkin tidak memiliki puncak ion molekul. Jika Anda memiliki daftar puncak ditabulasikan sebagai file teks dari Chemstation HP pada disk, Anda dapat men-download daftar puncak ke applet massa molar. 

Isotop Cluster menghitung pola isotop untuk rumus molekul tertentu. Ini termasuk periode perwakilan dan transisi unsur logam 3 dan 4. 

Massa Molar menghitung massa dan isotop pola molar untuk molekul tertentu yang ditentukan dalam format Smiles. 

Tripeptide Mass Finder searchs untuk ion di- atau tripeptide yang cocok dengan massa tertentu. 

Peptida Mass Finder menghitung massa ion untuk urutan peptida diberikan. Anda juga dapat merencanakan cluster isotop untuk ion. Applet ini memungkinkan untuk substitusi isotop stabil untuk asam amino dengan komposisi variabel untuk bentuk normal dan diganti. 

Solvent Cluster Ion Finder menemukan formula untuk ion klaster pelarut untuk latar belakang di MS ionisasi electrospray. 

Logam Kompleks Finder menemukan formula untuk sebuah kompleks anorganik . 

Pentaoligonucleotide Mass Finder searchs untuk di- untuk penta- ion oligonukleotida yang cocok dengan massa tertentu untuk mengisi, m / z. 

Cross-linker Menemukan semua link lintas mungkin, mencerna protein, dan daftar massa monoisotop setiap peptida cross-linked. 

Infra-Red Spektroskopi

IR Helper adalah tutorial langkah-demi-langkah pada interpretasi Infra-Red spektrum. (Internet Explorer dan sekarang bekerja dengan Safari!) 
Ini adalah versi baru. Jika Anda memiliki masalah dengan versi baru silakan e-mail twshattu@colby.edu.

IR Spectrum Explorer menampilkan spektrum IR JCAMP diformat dan menyoroti daerah kelompok fungsional untuk membantu interpretasi. (Internet Explorer, Safari, dan Chrome) 
      Coba juga IR Spectrum Explorer (Kecil) untuk layar yang lebih kecil.

Unit Konversi

Berikut adalah aplikasi konversi energi yang Anda akan menemukan membantu, terutama untuk mengkonversi Hartrees dan eV untuk kJ / mol dan rasio penduduk Boltzman.

Pembangun 3D-Molekul dan Molekuler Perhitungan Struktur

Membangun 3D-struktur molekul dan memprediksi IR-spektrum:

 

MM3 Mekanika Molekuler
MM3 mekanika molekul: webMM3

 Colby - Webmo Komputasi Kimia di WWW 

Charts korelasi

grafik Korelasi NMR 

HPLC Simulator

HPLC Simulator menggunakan model murni kesetimbangan untuk kromatografi untuk mensimulasikan pemisahan dua senyawa. Konstanta kesetimbangan dan koefisien partisi dapat diatur untuk semua kompleks yang membentuk termasuk dimer. Fase gerak dapat memiliki aditif, M, yang mungkin menjadi siklodekstrin, sebuah pasangan reagen ion, dll Detection dapat langsung atau tidak langsung, dengan menggunakan aditif fase gerak. Perhatian : JavaScript ini memakan waktu lama untuk menjalankan. Kolom 100 piring membutuhkan 20 detik. pada PC yang sangat cepat. Script ini berjalan menggunakan Netscape dan Internet Explorer pada Mac dan PC.

The Programmed HPLC Simulator lebih cepat dan memungkinkan aditif fase gerak untuk diprogram, yaitu berdenyut, sehingga Anda dapat melakukan beberapa kesetimbangan menarik penentuan konstan. Versi diprogram ditulis dalam FORTRAN dengan antarmuka cgi, sehingga kolom dengan ~ 1000 atau lebih piring berjalan dengan cepat.

Pengantar HPLC Simulator membahas teori dan aplikasi program. Komentar dan saran akan sangat membantu (2/7/02).

 Link WWW

Petunjuk Instrumen

Colby Instrumen Halaman : Petunjuk dan Panduan bagi Pengguna

NMR Tertentu

Fourier transform di Javascript (Jeff Clymer ini) 
NaDBS Integrated Spectral Data System dasar untuk Senyawa Organik 

NMRShiftDB , database spektral di Max Planck Institute of Chemical Ekologi 

Manis J aplikasi A Mac untuk menghitung konstanta J-kopling menggunakan Karplus dan Altona Persamaan. 

NMR Tabel Periodik (Bruker eNMR) 

NMR Tabel Periodik (Rider Univ.) 

NMR Tutorial (Rider Univ.) 

NMR Halaman di University of Potsdam memiliki on-line aplikasi untuk Interpretasi spektral NMR dan Mass Spec interpretasi, termasuk:

  • 1 H Wizard: Interaktif 1 H Kimia Pergeseran Korelasi Bagan
  • IR Wizard: IR Interaktif Korelasi Bagan
  • MS Wizard: Interaktif MS Fragment Bagan
  • AROSIM Perhitungan 13 C pergeseran kimia senyawa aromatik
  • Tabel Pergeseran kimia
  • Kopling Konstanta Ranges dari n J (H, H) - konstanta kopling
  • NMR- Pelarut: Sekilas pelarut umum di spektroskopi NMR-
       

Spektroskopi Masalah

University of Colorado Masalah Spektroskopi Organik (dengan jawaban). 

UCLA Webspectra (dengan jawaban). 

U. Notre Dame: A Workbook dari Unknowns 

The Wired Chemist

NMR Tutorial

NMR Tutorial (Rider Univ.) 

Pengantar NMR UWI-Mona 

Aplikasi dari 1 H NMR spektroskopi (P. Hallpap, H. Handel) 

Textbook Virtual Kimia Organik (W. Ruesch, Michigan State Univ.)

Pengantar Mass Spectrometry BM Tissue, U. Vermont 

Pengantar Mass Spectrometry L. Breci, U. Arizona

General Spektroskopi

National Institutes of Standar dan Teknologi Kimia Web Book mencakup termokimia dan gas IR fase dan data spektral massa. 

IR Wisaya IR Interaktif Korelasi Bagan 

MS Wisaya Interaktif MS Fragment Bagan 

Senyawa Organik database Cari dengan kriteria pencarian berdasarkan informasi dari Mass Spectrometry, UV / Visible penyerapan dan fungsional kelompok. 

NIST MS Program Cari untuk Windows memiliki aplikasi Interpretasi MS sangat berguna. 

Mekanika molekul dan Grafis

The RasMol Home page adalah sumber untuk aplikasi RasMol / RasMac dan informasi. 
Colby Tinggi Mekanika Molekuler Tutorial untuk Pengantar Mekanika Molekuler dan Molekuler Latihan Mekanika untuk latihan komputasi menggunakan mekanika molekul dan dinamika menggunakan MOE. 

Struktur molekul

The ChemSpider database struktur dicari dan luas. 

The RCSB Protein Data Bank adalah gudang X-ray dan NMR 3D-struktur protein dan asam nukleat. 

Perhitungan Struktur Molekul di Colby menggunakan teori kerapatan fungsional.

Referensi Umum

ChemInfo di Univ. dari Indiana akan membantu Anda menemukan dan belajar bagaimana menggunakan sumber daya informasi kimia di Internet dan di tempat lain.

 

Source: http://www.colby.edu/chemistry/NMR/NMR.html